棒爸工具箱

自從棒媽和棒蘇菲暑假結束回台灣後，棒爸開始覺得非得把博士班趕快念完不可，雖然現在霍普金斯醫學院各博士班的修業年限，平均起來都超過六年，但棒爸可不能磨這麼久，現在已經四年級，再怎麼樣也得想辦法五年就畢業，除了格外努力之外，還得把做事效率再提高才行；所以，棒爸上臉書的次數愈來愈少，連這部落格也荒了好一陣子，除了把手頭的實驗計畫趕快鋪下去，同時，今天終於把第二篇第一作者的文章修改送回雜誌社，居然，老闆還催着在兩個禮拜內，要棒爸把第三篇第一作者的文章也投出去，也就是十月十四日，這個兩個禮拜的奇蹟，如果真的發生，棒爸一定會再上來棒棒人家族慶祝一下。

總之，為了提高生產力，經過了一個多月的琢磨，棒爸投資了一些錢，買了下面這些軟體，發現真的都是寶物，受用無窮，愈是使用，愈是喜歡；所以覺得應該上來 “吃好到相報”，讓同樣使用蘋果電腦的夥伴們 “聞香”，探索一下是否也需要它們。


棒爸有幾萬封電子郵件，和許多師長，以及合作者之間的信件，都很重要，除了必須妥善保存，還得能夠隨時叫出來參考。先前棒爸用的是蘋果電腦內建的 Mail 軟體，但隨著信件一多，發現 Mail 常常老牛拖車，速度很慢。經過比較幾個電子郵件軟體，包括 EudoraOSE, Thunderbird, Postbox, MailForge, Outlook等等，棒爸最喜歡 Mailmate (http://freron.com/) ，速度快，功能相當強大，可以自定快速鍵，智慧型文件夾和搜尋的功能接近完美，對於多重往來的信件，也就是那些兩三個人，甚至更多人之間的信件往來，MailMate創造了一個特殊的的檢視模式，叫做 Thread Arcs（就翻譯成『對話弧』吧），用過的人，很難不喜歡，還沒看過其他電子郵件軟體有這麼方便的功能；另一個檢視模式也是相當實用，叫做Correspondence，可以針對特定對象，找出他和你之間所有的信件清單，時間的顯示是『三天前，兩個月前，一年前…』。軟體的開發者對於使用者的支援，很快，棒爸問過兩個問題，都在一天內解決；目前開發者正在研發MailMate和命令列（command line）之間的整合，對於Unix熟稔的人，MailMate恐怕將來會不斷端出好菜。所以，棒爸目前把MailMate封為 電子郵件之V怪客 （請見電影『V怪客』）。

 拜老闆所賜，棒爸目前手頭上超過六個合作案，昏天暗地，連棒蘇菲在美國的時候，都說要去跟棒爸的老闆抗議，害得棒爸老闆還買了一組彩色筆，收買棒蘇菲的心。總之，雖然棒爸不是當醫生，不像棒媽統攬全國性的業務，真要忙起來，也是常常容易左支右絀。直到，有人推薦OmniFocus （http://www.omnigroup.com/products/omnifocus/）給棒爸，對於個人工作與生活流程的安排，逐漸亂中有序，理出脈絡。最初，棒爸覺得OmniFocus似乎沒什麼了不起，好像不會比蘋果內建的行事曆高明，不過在試用過之後，棒爸逐漸體會OmniFocus的強大，譬如它甚至可以讓使用者自定模組式的流程，非常適合棒爸接合作案。所以，棒爸把OmniFocus封為行程管理之壹岐正（請見日劇『不毛地帶』）

這個美麗的海螺，名字叫做DEVONthink Pro Office ，它優雅的存在，為的是要超級優化檔案管理；以前覺得蘋果的Finder 已經算是很好用的系統，因為可以把檔案塗上各種顏色，在開啓檔案夾的時候，很快，甚至不需要看清楚名稱，都能正確無誤地開檔案。DEVONthink Pro Office 除了具備Finder的優點之外，對於把各種不同文件整合成一個健康的資料庫，手段巧妙細膩且才華洋溢，所以棒爸封DEVONthink Pro Office為檔案管理之尤達大師（請見電影『星際大戰』）。

棒爸工具箱裡的另一個寶貝，就是DEVONagent Pro。他的專長是網際網路搜尋，不過這裡指的，不是一般的搜尋；如果是要找電話，找地址和地圖，找人名，找特殊名詞定義，找產品，用Google就好了，而且恐怕Google還是比較快。但是，如果需要針對一個概念，一個物品，或是一個事件等等，想辦法發展出一套想法，並穿針引線，整合性地到碧落黃泉找影片，圖像，DEVONagent Pro可就幫大忙了，它可以組織出摘要，並讓使用者把搜尋方式模組化，而且和DEVONthink Pro Office完美接縫，棒爸把它封為網路搜尋之永遠的園丁（請見小說或電影『永遠的園丁』）

聯邦丘公園野餐和Fells Point碼頭散步

 聯邦丘是巴爾地摩市裡，另一個帶有淡水小鎮風情的地帶。附近有個地勢高的公園，很適合俯瞰巴爾地摩內港，公園裡插的美國國旗，還是建國早期的十五星旗。

最近內港旁邊，多了一排沙灘排球場，棒蘇菲看到小小出神一下。

 太陽下山後，到Fells Point碼頭散步吹風，泰珸士街上的風情，有別於巴爾地摩其他殘破的街景讓棒媽忍不住說，這才像美國嘛！

羅蘭公園鄉村學校

相較於之前的蒙特梭利學校，有一家離家較近的學校，叫做『羅蘭公園鄉村學校』（Roland Park Country School），環境也不錯，棒媽開車五分鐘就到了；反正只要有溜滑梯，棒蘇菲就可以玩得很開心。









棒爸和棒媽感到最驚奇的是，棒蘇菲雖然每天只在這裡上半天課，卻每天都有自己做的手工藝作品帶回家，熱氣球，火箭，跑車，彩虹，小鳥，老師們很用心準備每一天的課程。

主要的上課老師，就是Pam，總是帶著慈祥的笑容。











最後一天課程結束的時候，棒蘇菲很捨不得，抱抱Pam老師說再見，有機會再回來讀書。

總算回到DC

棒媽和棒蘇菲來到美國，過了一個多月，總算有機會回到DC的博物館區走走，棒媽背後就是史密森博物館總部，棒蘇菲被放下來後，二話不說，馬上玩起沙子。

棒蘇菲再來回味一下，小時候第一次做旋轉木馬的地方。

自然歷史博物館裡的水族箱，常常擠滿小朋友，因為...

有Nemo小丑魚！

和他的朋友Dorothy。

看煙火的女孩

巴爾地摩交響樂團每年在美國國慶日的時候，都會在Oregon Ridge公園戶外演出，雖然和柏林愛樂的森林音樂會不能比，但不失為闔家散心的好去處。

棒棒人家族到現場的時候，棒蘇菲剛睡醒，一臉搞不清楚狀況的樣子。

最後柴可夫斯基的1812序曲配上煙火，才勉強把棒蘇菲的瞌睡蟲趕走。

Carlyle公寓的玩票家政婦

剛開始還算稱職

後來玩Cosplay

Carlyle公寓家政課

正在幫棒媽揉麵團的棒蘇菲

索性玩起來

Carlyle公寓附近的兒童遊戲區

棒爸現在住的公寓Carlyle走路十分鐘的地方，有個兒童遊戲區，綠意盎然，旁邊還有淺到不能再淺的潺潺小溪， 散步起來很舒服，棒蘇菲每次走到快到遊戲區的時候，總是迫不及待，一馬當先跑過去。

 在這個遊戲區，棒蘇菲最喜歡的玩樂項目，是照片最右邊那個彎彎的，可以爬上去的梯子，她叫它，『毛毛蟲』。

 其實棒蘇菲是個比較沒膽的小朋友，像這種陽春鞦韆，沒有前後包起來的座椅，不太敢盪。

棒蘇菲要求棒媽，一定還要再回來玩。

在Akhilesh家歡送鍾俊

棒爸指導教授Akhilesh的新居落成了一年，終於藉著歡送鍾俊博士的機會，門戶大開，邀請大家去吃晚餐，這間位於Ellicott City新透天厝，說大不大，但很別緻。

棒蘇菲和Akhilesh的兩個女孩玩在一起，捨不得回家。

棒媽和棒爸在Akhilesh老婆Anity的畫作前合影。

巴爾地摩的蒙特梭利學校

 棒蘇菲暑假來美國，讀了兩家學校，第一家是在巴爾地摩郡的蒙特梭利學校；幼幼班的老師，是Nancy和Mary，Nancy老師教棒蘇菲做了幾個手環，Mary則是每天準時早上九點，都會站在走廊上，把棒媽車上的棒蘇菲抱下車，棒爸戲稱，美國連幼稚園都是『得來速』（Drive-Through），也就是速食店那種不用下車，也能點餐，取餐和付錢的方式。

棒蘇菲在學校，感覺起來好像還能適應。

每天就是在這個走廊上，被Mary老師『得來速』接走。

夢想如何起飛

想想若是沒有猛烈的燃燒，偌大的熱氣球如何升空？

棒爸雖然停筆了一個多月，沒來寫棒棒人家族，但生活的緊湊程度，卻是一年來最忙的一陣子。棒蘇菲回到巴爾地摩，花了一個星期調好時差，就開始參加夏令營，一個月來，去了兩所學校，都是第一天就進入狀況，玩得很開心，棒爸很欣慰；棒媽因為必須接送棒蘇菲上下學，趕鴨子上架，把開車技巧在兩天內練好，棒爸更是感到很驕傲。至於棒爸自己的學校生活，也不是三兩下就能打發掉的事，實際上，不論是兵馬倥傯的實驗操作，或是嘔心瀝血的論文寫作，都考驗著抗壓性；好在，一切都逐漸上軌道，熱氣球就要升空了。

那些偶像教棒爸的事＿『克立克』篇

棒爸的頭號偶像，法蘭西斯 • 克立克（Francis Crick），被譽為繼達爾文以來，最偉大的理論生物學家（Theoretical Biologists)。『理論生物學』的粗淺定義是，透過觀察與實驗，致力於構築具有一般通用性架構的生物學理論，並根據該理論，進行預測。基本上，這個領域自從一九六〇年代逐漸成型以來，其實不太成氣候，最大的原因是，太少人可以達到讓眾人臣服的境界。

克立克與華生（James Watson），還有威金斯（Maurice Wilkins），因為在1953年一起解開DNA雙股螺旋的結構，獲頒1962年的諾貝爾獎；不只如此，克立克當年站在分子生物學的浪頭上，和其他人包括布蘭納（Sydney Brenner），解開遺傳密碼由每三個鹼基組成，他們1961年那篇利用噬菌體實驗進行推論，解開遺傳密碼的論文，被曾任『自然』雜誌22年編輯的約翰 • 麥道克斯爵士，譽為『自然』雜誌有史以來最優美的論文。克立克拿手好戲就是，藉由非常非常廣泛地閱讀論文，深入地思考，再搭配上實驗數字的計算，得到對生物學的洞見（insight），然後提出假設和預測；和克立克同一世代的生物學家，大都對他的這項工夫，十分佩服。

不過棒爸這篇文章的目的，不是要仔細介紹克立克的生平，而是著重於克立克教給棒爸的兩件事。

第一件事是，『多多和同儕對話』。雖然克立克不認為自己是個理論家，因為他也非常喜歡作實驗，但不可否認的，克利克在理論構築上，相當傑出。對於這項造詣，他指出：『構築理論的人，相當於是拿別人實驗的結果，作為自己思考的材料（raw material），所以，對於人的瞭解，和對於實驗的瞭解，一樣重要』......『如此一來，藉由和同儕對話，即使只是很短的時間，你才知道，他們可能犯什麼錯誤，這比光讀論文來得容易』......『通常從談話的內容，你就可以得知，對方是深入的思考者（deep thinker）或是非常小心的實驗家』......『對於構築理論的人，很重要的是，不能只和常與自己工作的實驗家互動，應該也要和自己不熟的人互動』。不止如此，克立克喜歡在他的科學工作中，找人建立『對話者』的關係，這對話者不只是聊聊天，或是分享心情，而是很嚴肅的邏輯思考交換，藉由一來一往的互相質疑獲肯定，不斷迸出智慧的火花和洞見。所以，在解開DNA結構的年代，克立克的對話者就是華生；在解開遺傳密碼的年代，他的對話者是布蘭納（他們其實坐在同一間辦公室），最後在克立克嘗試了解意識之謎的年代，他的對話者是科霍（Christof Koch）。針對這種對話者之間的相處之道，他指出『要坦白，但不能無禮』。

第二件事是，『永遠嘗試瞭解事物的本質』。有一個BBC的廣播節目，叫做 The Life Scientific，有一次專訪2001年的諾貝爾獎得主Tim Hunt，他回憶到，他在劍橋大學唸書的時候，大約是克立克和華生解開DNA結構的十年後，當時他常常會遇到克立克也參加專題討論，坐在後排；Hunt 說，他覺得大部分的劍橋學者，在專題討論會上發問問題，都是有意無意展現自己有多聰明，但他發現克立克問問題的方式和出發點不太一樣，雖然當時聲望已如日中天，克立克問問題總是因為，他為了想更瞭解演講者主題的本質，但想不通，所以請演講者試著作更清楚或更直接的闡述。在一九八〇年代BBC Radio 3有個節目，主題是『對科學的熱情』，主持人Lewis Wolpert教授曾問克立克：『你說話的方式有一個特質，就是把事情表達得相當清楚（tremendous clarity），你不會說出我覺得相當難懂的東西，你是很刻意這麼做嗎？』，克立克回答：『不是，我自己沒有發現是這樣的。我想是因為，我的心思單純，而且我都必須在心裡解釋給自己聽，所以我對人說話的方式，其實和我對自己說話的方式相同......』（這篇文章中許多克立克的話，都是棒爸從這個專訪中看來的，算是註明出處吧）

這些都是克立克教給棒爸很珍貴的人生智慧，其實不管做不做研究，都很受用，若想好好了解克立克，請務必看兩本書，分別是由Matt Ridley寫的克立克傳記 （紐約時報專文介紹）以及由華生寫的 "Double Helix" 。這本膾炙人口的小冊子，棒爸會推薦給任何一位對生物醫學有興趣的學生。在它短短的章節當中，可以巧妙地體會到整個生物醫學界的各個面向，例如同儕間的競爭，探索未知的興奮，以及生涯發展的考量等等，還有許許多多的寶貴觀察，都濃縮在這本小冊子，不管大環境如何改變，書中的智慧，都會適用。這個公仔（連公仔都買了，應該算偶像了吧），是棒爸在冷泉港實驗室開會的時候，在地下室書店買的，現在就常常陪著棒爸讀書，吸收經驗和知識，希望可以把它們轉化為智慧。

找誰當典範？

有時候，棒爸還是隻慢吞吞的老牛，由『老闆』在後面鞭策着。

大約一個月前， 棒爸和老闆Akhilesh坐在一起討論該怎麼回信給一位合作者，Akhilesh發現棒爸情報搜集不足，思考不夠縝密，便火急攻心地說：『What are you bull-shitting? I don't know who your role model  is. You're going nowhere!』（翻譯：你在鬼扯什麼？我不知道你的典範是誰，你這樣下去會完蛋！）

老闆這裡講的『典範』，就是『偶像』，『學習模仿的對象』。他這轟天一問，倒是讓棒爸回頭想了好幾回，是啊，心中已經好久沒有真正設定一個『學習模仿的對象』了。小學在球隊，中學在讀書，一直都有學長在前面作典範；上了大學，突然進入破除偶像迷思（iconoclasticism）的年代，覺得自己的路，和人不同，別人的經歷和時空背景也都不同，何來學習與模仿；現在想想，其實可以用另一個層次看『典範』，簡單地講，除了可以把『典範』當做是私淑老師之外，何嘗不能當做精神上的諮詢對象？棒爸讀博士班以來，從吸收到的資訊和知識，或是談過話相處過的人之中，的確找到幾個人，對他們特別拜服，值得當做學習模仿的對象，接下來的幾篇文章，棒爸會把這些關於研究專業上的『偶像』，分享給大家，並說說何以如此。

高溫棒球

棒棒人家族沉寂了好一陣子，因為正在為這個精彩的夏天做準備！棒媽即將在六月的最後一天，帶著棒蘇菲，再度踏上睽違一年的美國國土，棒爸除了必須在實驗室研究工作上做些安排，也得著手安排棒蘇菲來美國上學的學校，同時幫棒媽找找可以同時兼顧消遣和學習的地方。而目前整個巴爾地摩，正洋溢着這幾年所未見的棒球熱。

今天的巴爾地摩也是相當炎熱，華氏94度，相當於攝氏三十四度，金鶯隊正和國聯的費城人隊打跨聯盟的第三戰；昨晚的第二戰，Adam Jones的再見全壘打（walk-off homerun）可著實讓整個球場的費城人球迷把這口氣吞下去；有誰會料到，長年雄霸國聯東區的費城人隊，現在可是在該區後段班吊車尾。

相反地，這個球季，金鶯隊不再像之前總是當美聯東區的地窖居民，戰績大幅躍進，現正和洋基隊以及光芒隊在美聯東區處於領先集團；棒爸因為正幫老鼠們作骨髓移植，最近常泡在老鼠房17A，裡面管理員Wayne，是標準的金鶯隊球迷，就是不管金鶯隊戰績好或壞，都忠心支持的那種球迷。他一聽到棒爸來自於台灣，馬上開始攀談，大讚陳偉殷（Wei-Yin Chen），認為陳偉殷是金鶯隊目前最可靠的投手，穩定性不錯，球速和心理素質都夠，才二十六歲，總之，他說金鶯隊簽下他，是他覺得近幾年最聰明的選擇。經過Wayne的介紹，現在棒爸都把車上的廣播，調準AM1090，音質出奇地好，學點棒球美語；然後等棒棒人家族七月正式合體，再把那兩個活力充沛的女生，帶進金鶯隊主球場（Camden Yard），找個晚上，去叫喊叫喊。